تنوع زیستی و مولکولی ویروس موزاییک لکه سبز خیار در اسپانیا

Biological and Molecular Diversity of Cucumber green mottle mosaic virus in Spain

Oscar CrespoDirk JanssenCarmen García, and Leticia RuizInstituto Andaluz de Investigacion y Formacion Agraria y Pesquera (IFAPA), 04745 La Mojonera, Almeria, Spain

Abstract

The complete RNA genome from Cucumber green mottle mosaic virus (CGMMV) (Alm08), collected during 2009 in cucumber crops located in Spain, was found to be 6,422 nucleotides long. The nucleotide sequence shared the highest identity with isolates from Russia (GQ495274, GQ495275, FJ848666) as do nucleotide sequences of partial CP and MP genes described in Spain since 2005. All the partial genome sequences including RdRp, CP, and MP from 26 isolates collected from 2013 to 2015 in the southeast of Spain, and from seven isolates of other parts of the world, suggest that they grouped in two major clusters: one cluster (I) included 14 isolates collected between 2013 and 2014, and also reference isolates from France, the Netherlands, and Uzbekistan. A second cluster (II) grouped 12 isolates, which were mostly collected in 2015 together with those from Japan, South Korea, and Canada. For the first time, CGMMV isolates of different geographical origin were found coinfecting the same crop and territory. A host range study revealed that representative isolates of cluster II, but not from cluster I, produced local lesions in Chenopodium amaranticolor. RT-PCR using a common primer pair for CGMMV followed by restriction enzyme analysis with KpnI allowed distinguishing cluster I from II CGMMV isolates.

ترجمه ی فارسی بخشی از خلاصه ی مقاله : 

ژنوم RNA ویروس موزاییک لکه سبز کامل از خبار سبز  (CGMMV) (Alm08)، در سال ۲۰۰۹ جمع آوری شده در محصولات خیار واقع در اسپانیا، به ۶۴۲۲ نوکلئوتید طول پیدا شد توالی نوکلئوتیدی بیشترین هویت را با جدایی از روسیه (GQ495274، GQ495275، FJ848666) به عنوان توالی نوکلئوتیدی ژنهای CP و MP جزئی که در اسپانیا از سال ۲۰۰۵ مشخص شده است، به اشتراک می گذارد.تمام توالی های ژنومی نسبی از جمله RdRp، CP و MP از ۲۶ جدایه از ۲۰۱۳ تا ۲۰۱۵ در جنوب شرقی اسپانیا و از هفت جدایه های دیگر مناطق جهان جمع آوری شده است که نشان می دهد که آنها در دو خوشه بزرگ دسته بندی شده اند: یک خوشه (I ) شامل ۱۴ جدایه جمع آوری شده بین سال های ۲۰۱۳ تا ۲۰۱۴، و همچنین جدایی های مرجع از فرانسه، هلند و ازبکستان بود. خوشه دوم (II) 12 جدایه را دسته بندی کرد که بیشتر در سال ۲۰۱۵ با هم از ژاپن، کره جنوبی و کانادا جمع آوری شد. برای اولین بار، جدایه های CGMMV از منشاء مختلف جغرافیایی با هم توسط همان محصول و قلمرو یافت شدند.

دانلود مخصوص کاربران عضو سایت است. برای نمایش لینک دانلود باید در سایت عضو شوید یا وارد حساب کاربری خود شوید !

دانشجوی رشته گیاه پزشکی ، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان،

کانال تلگرام

اگر می‌خواهید از آخرین و محبوب‌ترین مقالات ما در ایمیل خود مطلع شوید، همین الان ایمیل خود را در کادر زیر وارد کنید

[mailpoet_form id="1"]

تعداد علاقه‌مندانی که تاکنون عضو خبرنامه ما شده‌اند

۳۲

مطالب دانلودی مرتبط :

دیدگاه خود را بیان کنید :

نشانی ایمیل شما منتشر نخواهد شد. بخش‌های موردنیاز علامت‌گذاری شده‌اند *